ใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร เพื่อนำกลุ่มอัลคิลที่มีฟลูออรีนเข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย การมีโบรมีนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาคัปปลิง ในขณะที่การแทนที่ฟลูออรีนสองอะตอมติดกันในโซ่ช่วยปรับความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิกในสารชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาบล็อกสร้างพิเศษที่มีฟลูออรีนสำหรับงานวิจัยเคมียารักษาโรค