2-Chloro-5-fluoronitrobenzene ถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีและยา เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งหมู่คลอรีน ฟลูออรีน และไนโตร ทำให้เหมาะสำหรับการทำปฏิกิริยาออร์แกนิกต่างๆ เช่น ปฏิกิริยาการแทนที่นิวคลีโอไฟล์ (nucleophilic substitution) ซึ่งนำไปสู่การสร้างสารประกอบที่มีความหลากหลายและมีความสำคัญทางเภสัชกรรม นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเคมีเพื่อผลิตสารกำจัดศัตรูพืชและสารป้องกันเชื้อรา เนื่องจากมีฤทธิ์ทางชีวภาพที่แข็งแกร่งและสามารถปรับปรุงประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์ได้