3,4,5-ไตรฟลูออโรไนโตรเบนซีนถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีอื่นๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและเกษตรกรรม เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งกลุ่มไนโตรและฟลูออรีน ทำให้มีปฏิกิริยาที่หลากหลายและเหมาะสมสำหรับการสร้างสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านจุลชีพหรือยาต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการวิจัยและพัฒนาสารเคมีใหม่ๆ ในห้องปฏิบัติการ เพื่อศึกษาคุณสมบัติและปฏิกิริยาต่างๆ ของสารประกอบฟลูออรีน