ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างอะโรมาติกฟลูออรีนช่วยเพิ่มความจำเพาะในการจับและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมในยาตัวสมัคร นอกจากนี้ยังใช้ในสารเคมีเกษตรสำหรับสารป้องกันพืช เนื่องจากช่วยปรับปรุง lipophilicity และการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ นิยมใช้ในเคมียารักษาโรคสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) ที่เกี่ยวข้องกับฮีเทอโรไซเคิลที่มีไนโตรเจน