ใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร โดยเฉพาะสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดแมลง โครงสร้างของมันช่วยให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกเฉพาะ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างส่วนประกอบที่ออกฤทธิ์ซึ่งเล็งเป้าไปที่ศัตรูพืชเฉพาะ ขณะที่ลดผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อม นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเภสัชกรรมเพื่อพัฒนาสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกที่ฟลูออรีนไนซ์ โดยหมู่ฟลูออรีนและคลอรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมในร่างกาย ใช้ทั่วไปในปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิงเพื่อนำหมู่ 2,6-ไดคลอโร-3-ฟลูออโรไพรีดิลเข้าไปในโมเลกุลที่ใหญ่กว่า ซึ่งช่วยให้ปรับแต่งกิจกรรมทางชีวภาพในตัวแทนป้องกันพืชและยารักษาได้อย่างละเอียด