ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิกที่มีไนโตรเจน หมู่ไอโซไซยาโนเข้าร่วมในปฏิกิริยาแบบมัลติคอมโพเนนต์ เช่น ปฏิกิริยา Ugi และ Passerini ซึ่งช่วยในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนได้อย่างมีประสิทธิภาพ หมู่ tosyl ช่วย стабилизироватьคาร์บาไนออนที่อยู่ติดกัน ทำให้มีประโยชน์ในปฏิกิริยาอัลคิเลชันและไซคลิเซชัน ใช้กันทั่วไปในเคมียารักษาเพื่อพัฒนาเปปไทโดมิมิติกส์และโครงสร้างโมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้