ใช้ในงานวิจัยเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการพัฒนายาเพื่อรักษาโรคทางระบบประสาทและมะเร็ง โครงสร้างของสารนี้ช่วยให้จับกับจุดออกฤทธิ์ของเอนไซม์ต่างๆ ทำให้มีคุณค่าในการค้นคว้ายา นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาความสามารถในการก่อกลายพันธุ์และก่อมะเร็ง เนื่องจากสามารถโต้ตอบกับดีเอ็นเอ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในฐานะสารประกอบกลุ่มอินโดลที่แทรกตัวเข้าไปในสายดีเอ็นเอ ทำให้เกิดความผิดปกติในการถอดรหัสพันธุกรรม จึงถูกใช้เป็นโมเดลในการศึกษาความเป็นพิษต่อเซลล์และศักยภาพในการก่อมะเร็ง พบการใช้ทั่วไปในการออกแบบตัวยับยั้ง kinase และยาต้านจุลินทรีย์ ใช้อย่างแพร่หลายในงานสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการสร้างระบบ heterocyclic ที่ซับซ้อน รวมถึงการพัฒนายาที่ยับยั้งเอนไซม์บางชนิด เช่น topoisomerase ซึ่งเกี่ยวข้องกับการซ่อมแซมดีเอ็นเอและการแบ่งเซลล์