ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งคินาสสำหรับการรักษามะเร็ง ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในเคมียารักษาโรค เนื่องจากแกนอินดาโซลซึ่งเป็นที่รู้จักในการส่งเสริมกิจกรรมทางชีวภาพในยาที่เป็นผู้สมัครยา ใช้กันทั่วไปในการเตรียมตัวยับยั้งแบบเลือกสรรที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับเส้นทางส่งสัญญาณในเซลล์ นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในสถานที่วิจัยสำหรับการออกแบบโมเลกุลชีวภาพใหม่ที่มีศักยภาพต้านการอักเสบ ต้านไวรัส หรือปกป้องระบบประสาท กลุ่มฟังก์ชันอะมิโนและเมทอกซี่ช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนได้ง่าย ส่งเสริมการสร้างห้องสมุดสารประกอบที่หลากหลายสำหรับการคัดกรองแบบไฮสปีดในกระบวนการค้นพบยา