สารนี้ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์สารชีวโมเลกุลที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในงานสังเคราะห์สารธรรมชาติที่มีโครงสร้างเป็นไซคลิกหรือสารประกอบไซโคลเพนตานที่พบในสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านมะเร็งหรือยาต้านไวรัส หมู่ tert-butyldiphenylsilyl (TBDPS) ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกัน (protecting group) สำหรับหมู่แอลกอฮอล์ ซึ่งช่วยควบคุมความจำเพาะในการทำปฏิกิริยาเคมีในขั้นตอนต่อไปได้อย่างแม่นยำ โดยเฉพาะในสภาวะที่มีสารตัวทำปฏิกิริยาหรือตัวเร่งปฏิกิริยาที่ไวต่อหมู่ -OH โครงสร้างที่มีทั้งหมู่ไซคลิกและหมู่ฟังก์ชันที่ถูกป้องกันนี้จึงเหมาะสำหรับการสร้างโมเลกุลแบบหลายขั้นตอน (multi-step synthesis) ที่ต้องการความบริสุทธิ์และผลผลิตสูง