ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase สำหรับการรักษามะเร็ง เป็นบล็อกพื้นฐานในเคมียารักษาเนื่องจากสามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกสรรที่ตำแหน่งบรอมโม ซึ่งช่วยให้เกิดพันธะ C-C และ C-N ใช้บ่อยในการเตรียมโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพที่เล็งเป้าไปยังการอักเสบ โรคเสื่อมถอยของระบบประสาท และโรคเมแทบอลิซึม โครงสร้างแกนอินดาโซลให้ความเสถียรทางโครงสร้างและปฏิสัมพันธ์ที่ดีกับบริเวณออกฤทธิ์ของเอนไซม์ ทำให้มีคุณค่าในการวิจัยค้นพบยา นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารอ้างอิงหรือมาตรฐานในห้องปฏิบัติการวิเคราะห์สารเคมีชีวภาพ