ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะสารที่ออกฤทธิ์เกี่ยวข้องกับตัวรับเซโรโทนิน (serotonin receptors) ซึ่งเกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง มีศักยภาพในการพัฒนาเป็นยารักษาโรคทางจิตเวช เช่น ภาวะซึมเศร้า วิตกกังวล หรือโรคจิตบางชนิด นอกจากนี้ยังใช้เป็นโครงสร้างหลักในการออกแบบสารยับยั้งเอนไซม์บางชนิด เช่น เอนไซม์ kinase ที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็ง จึงมีความน่าสนใจในงานค้นหายาต้านมะเร็ง ยังพบว่าสารอนุพันธ์ของอินโดลมีคุณสมบัติเป็นสารต้านอนุมูลอิสระ และสามารถใช้ในงานวัสดุศาสตร์ เช่น การพัฒนาสารเรืองแสงหรือเซนเซอร์ตรวจจับสารเคมีเฉพาะชนิด