ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบออร์แกนิกที่มีโครงสร้างไตรอะซีน ซึ่งมีศักยภาพในการนำไปพัฒนาเป็นสารต้านจุลชีพหรือสารต้านมะเร็ง โดยโครงสร้างที่มีไซยาโนกรุ๊ปและคลอโรไตรอะซีนช่วยเสริมฤทธิ์ทางชีวภาพ นิยมใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเพื่อสร้างสารนำร่องใหม่ นอกจากนี้ยังใช้เป็นรีเอเจนต์ในการสร้างพันธะโควาเลนต์กับสารชีวโมเลกุลในงานโปรตีโอมิกส์และการติดฉลากโปรตีน