ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มที่มีเป้าหมายเกี่ยวข้องกับเอนไซม์ไคเนส (kinase inhibitors) ซึ่งมีศักยภาพในการพัฒนาเป็นยารักษาโรคมะเร็ง สารนี้ยังถูกใช้เป็นโมเลกุลสำคัญในการออกแบบยาที่ต้องการความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างของอินดาโซลมีความสามารถในการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพได้ดี และการแทนที่ด้วยหมู่บรอมมีนช่วยเพิ่มคุณสมบัติด้านการละลายและการจับกับเป้าหมาย