ใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์และเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกระบวนการพัฒนายาที่มีเป้าหมายไปที่ตัวรับหรือเอนไซม์เฉพาะ โครงสร้างของอินดาโซลที่มีการแทนที่ด้วยฮาโลเจนหลายตำแหน่งช่วยเพิ่มความสามารถในการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพ และสามารถปรับเปลี่ยนคุณสมบัติทางเคมีและฟาร์มาซีได้ นิยมใช้ในขั้นตอนการคัดกรองสารออกฤทธิ์และการออกแบบสารนำร่องในห้องปฏิบัติการ