ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาเภสัชภัณฑ์ ทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยพื้นฐานในการสร้างวงแหวนเฮเทอโรไซคลิกที่มีไนโตรเจนซับซ้อน ซึ่งพบได้บ่อยในโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในเคมีทางการแพทย์สำหรับการค้นพบยา ใช้กันทั่วไปในการสังเคราะห์ตัวยับยั้งโปรติเอสและยาสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากความเสถียรและปฏิกิริยาของวงแหวนพิเพอริดีนที่ได้รับการป้องกันโดยกลุ่มฟลูออเรนิล นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตายิ่งเป็นกลยุทธ์กลุ่มป้องกันเมื่อปรับเปลี่ยนให้เหมาะสม