ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง นิยมใช้พัฒนาโมเลกุลใหม่ที่มีเป้าหมายในการยับยั้งเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะเจาะจง เช่น ตัวรับ GABA หรือเอนไซม์ฟอสโฟดีเอสเทอเรส มีศักยภาพในการนำไปใช้ค้นคว้าเกี่ยวกับโรคทางระบบประสาท เช่น โรคอัลไซเมอร์ หรือโรควิตกกังวล รวมถึงการศึกษาโครงสร้าง-ฤทธิ์ของสารกลุ่มอินดาโซล