ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase สำหรับการรักษามะเร็ง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถดัดแปลงได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์สูง ใช้กันทั่วไปในการวิจัยเคมียารักษาเพื่อสร้างยาตัวสมัครที่มีฐานอินดาโซล โดยมุ่งเป้าไปที่โรคอักเสบและโรคทางระบบประสาท นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารประกอบที่ติดรังสีสำหรับการศึกษาการถ่ายภาพ เนื่องจากมีไอโอดีน ทำให้สามารถติดตามในระบบชีวภาพได้ นอกจากนี้ ยังใช้เป็นรีเอเจนต์ในการทำปฏิกิริยาการจับคู่แบบเร่งปฏิกิริยาด้วยพัลลาเดียม เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Sonogashira สำหรับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน