ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านเชื้อราและยารักษามะเร็ง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับแต่งได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาเพื่อสร้างส่วนประกอบที่ใช้งานได้ในกระบวนการค้นพบยา นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีเป็นสารตั้งต้นเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพของยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช เนื่องจากความเสถียรและปฏิกิริยาที่ดี มักใช้ในงานวิจัยเพื่อออกแบบสารประกอบเบสไพรีมีดีนใหม่ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ