ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างพิริมิดีน ซึ่งเป็นแกนสำคัญในยาหลายชนิด โดยเฉพาะยาต้านไวรัส ยาต้านมะเร็ง และยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถทำปฏิกิริยากับเป้าหมายทางชีวภาพได้ดี จึงนิยมใช้เป็นตัวตั้งต้นในการพัฒนายาใหม่ในห้องปฏิบัติการวิจัยยา นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างสารอนุพันธ์ที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น สารเรืองแสงหรือสารตัวเร่งปฏิกิริยาในกระบวนการเคมี