ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง และสารต้านจุลชีพ นิยมใช้ในขั้นตอนการพัฒนายาใหม่ที่ต้องการโครงสร้าง heterocyclic ที่มีความเฉพาะเจาะจงสูง นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการศึกษาโครงสร้าง-กิจกรรมของสาร quinoxaline เพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพและลดผลข้างเคียงของยา