ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมสำหรับการเตรียมสารประกอบชีวภาพที่มีฤทธิ์. มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนายาบางชนิด เนื่องจากโครงสร้างเฮเตอร์โรไซคลิกของมัน ซึ่งสามารถเลียนแบบสารตั้งต้นจากธรรมชาติในระบบชีวภาพ. นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อสังเคราะห์สารประกอบอนุพันธ์มอร์โฟลีนใหม่ที่มีศักยภาพในการรักษา. รูปแบบเกลือไฮโดรคลอไรด์ช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายและความเสถียร ทำให้เหมาะสำหรับการใช้ในสภาพแวดล้อมปฏิกิริยาแบบน้ำ.