ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งโปรตอนปั๊มและยาต้านเชื้อรา โครงสร้างของมันสนับสนุนการประสานกับไอออนโลหะ ทำให้มีคุณค่าในการเร่งปฏิกิริยาเคมีและในการออกแบบโครงสร้างโลหะ-อินทรีย์ (metal-organic frameworks) นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยเพื่อพัฒนาสารประกอบชีวภาพใหม่ เนื่องจากแกนเบนโซอิมิดาโซลที่เป็นที่รู้จักในการโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพ