ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) ที่ต้องการการป้องกันหมู่อะมีน หมู่ Boc (tert-butoxycarbonyl) ให้การป้องกันอะมีนที่ย้อนกลับได้ในระหว่างการสังเคราะห์หลายขั้นตอน ในขณะที่หมู่เมซิเลต (methanesulfonate) ทำหน้าที่เป็นหมู่ที่ออกง่าย ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการแทนที่นิวคลีโอไฟล์ ใช้กันทั่วไปในการเตรียมยาเฉพาะที่เป็นเบสไพพีรีดีน รวมถึงยาที่เล็งเป้าไปที่ความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลางและพื้นที่บำบัดอื่นๆ ที่ต้องการฮีเทอโรไซเคิลที่มีไนโตรเจน โครงสร้างของมันช่วยให้การฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกสรรที่ตำแหน่งเฉพาะ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนด้วยความบริสุทธิ์และผลผลิตสูง