ใช้เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างแกนกลางเพอราซีนที่มีการป้องกัน N-Boc ช่วยให้สามารถดัดแปลงเลือกเฉพาะได้ในปฏิกิริยาออร์แกนิกหลายขั้นตอน ทำให้มีคุณค่าในเคมีเภสัชกรรมสำหรับการสร้างยาตัวประกอบซับซ้อน หมู่ 3-คาร์บอกซี-4-ไนโตรฟีนิล ให้หมู่คาร์บอกซิลิกสำหรับการเชื่อมต่อและปฏิกิริยาคัปปลิ้ง เช่น การสร้างพันธะเอไมด์หรือยึดติดกับพื้นผิวแข็งในเคมีคอมบิเนตอเรียล ในขณะที่หมู่ไนโตรทำหน้าที่เป็นกลุ่มดึงอิเล็กตรอนที่ช่วยอำนวยการลดหรือเพิ่มการดูดซับรังสี UV สำหรับการวิเคราะห์ นิยมใช้ในงานวิจัยเพื่อออกแบบสารที่มีศักยภาพต้านมะเร็ง ต้านการอักเสบ หรือปรับเปลี่ยนระบบประสาทส่วนกลาง