PT2399 ถูกใช้ในการวิจัยทางการแพทย์เพื่อศึกษากลไกการทำงานของโปรตีน HIF-2α ซึ่งเกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็ง โดยเฉพาะมะเร็งไต ตัวยานี้มีศักยภาพในการยับยั้งการทำงานของ HIF-2α ทำให้สามารถชะลอหรือหยุดการเติบโตของเนื้องอกได้ นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเพื่อประเมินประสิทธิภาพและความปลอดภัยของ PT2399 ในการรักษามะเร็งชนิดอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องกับ HIF-2α อีกด้วย