Ruthenium Red ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีววิทยาในฐานะสารย้อมสีเพื่อแสดงภาพช่องแคลเซียมและโปรตีนที่จับแคลเซียมในเซลล์ ช่วยในการศึกษากระบวนการเซลล์ที่เกี่ยวข้องกับการส่งสัญญาณแคลเซียม ซึ่งมีความสำคัญต่อการเข้าใจการหดตัวของกล้ามเนื้อ การปล่อยสารสื่อประสาท และกลไกการตายของเซลล์ นอกจากนี้ ยังใช้ในกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนเพื่อเพิ่มความเปรียบต่างของโครงสร้างเซลล์ โดยเฉพาะในไมโทคอนเดรียและ endoplasmic reticulum ในเภสัชวิทยา Ruthenium Red ถูกนำมาใช้เพื่อตรวจสอบบทบาทของแคลเซียมในโรคต่างๆ เช่น โรคเสื่อมของระบบประสาทและความผิดปกติของหัวใจ ช่วยในการพัฒนาการรักษาที่กำหนดเป้าหมาย ความสามารถในการยับยั้งช่องแคลเซียมบางชนิดทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการศึกษากลไกที่ขึ้นกับแคลเซียมในสรีรวิทยาเซลล์