สารละลายแอมโมเนียมอะซิเตตถูกใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยทางชีวเคมี โดยเฉพาะในการเตรียมบัฟเฟอร์สำหรับโครมาโทกราฟีของเหลวประสิทธิภาพสูง (HPLC) และสเปกโตรเมตรีมวล (MS) มันทำหน้าที่เป็นบัฟเฟอร์ที่ระเหยได้ง่าย ทำให้เหมาะสมสำหรับเทคนิคการวิเคราะห์เหล่านี้เนื่องจากทิ้งสารตกค้างน้อย ส่งผลให้ได้ผลลัพธ์ที่สะอาดและแม่นยำ ในชีววิทยาโมเลกุล มันถูกใช้ในขั้นตอนการตกตะกอน DNA และ RNA เพื่อช่วยในการทำให้บริสุทธิ์กรดนิวคลีอิก นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการศึกษาการตกผลึกโปรตีน ซึ่งความสามารถในการบัฟเฟอร์ช่วยรักษาสภาวะ pH ที่เสถียร สารละลายนี้ยังพบการใช้งานในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่างๆ โดยทำหน้าที่เป็นแหล่งของไอออนอะซิเตตในปฏิกิริยาเคมี ความหลากหลายและประสิทธิภาพทำให้เป็นสารเคมีที่สำคัญในทั้งเคมีวิเคราะห์และเคมีสังเคราะห์