อะซิทิมิโดไฮดราซิด ไฮโดรคลอไรด์ถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีต่างๆ โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยารักษาโรคและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม มันมีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาต้านเชื้อแบคทีเรียและยาต้านไวรัส นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์และปฏิกิริยาเคมีที่เกี่ยวข้องกับการสร้างพันธะเปปไทด์ อีกทั้งยังเป็นส่วนประกอบในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีที่ใช้ในการวินิจฉัยโรคและการทดสอบทางคลินิกอีกด้วย