เบนซิลไฮดราซีน ไดไฮโดรคลอไรด์ ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารเคมีช่วยในการเตรียมอนุพันธ์ไฮดราซีนต่าง ๆ มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีคุณสมบัติบำบัดที่เป็นไปได้ ในเคมียารักษาโรค มันถูกนำมาใช้ในการสร้างอนุพันธ์ไฮดราซิดและไฮดราซอน ซึ่งมักถูกสำรวจเพื่อกิจกรรมต้านจุลินทรีย์ ต้านมะเร็ง และต้านการอักเสบ นอกจากนี้ มันยังพบการประยุกต์ใช้ในการพัฒนาสารเคมีเกษตร ซึ่งช่วยในการสังเคราะห์ยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช บทบาทของมันในการวิจัยทางเคมีรวมถึงการอำนวยความสะดวกในการศึกษากลไกปฏิกิริยาและการพัฒนาสารประกอบอินทรีย์ใหม่