Naphthalen-2-ylhydrazine hydrochloride ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านการวิจัยทางเคมีและชีวเคมี โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีต่าง ๆ มักใช้เป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น สารประกอบเฮเทอโรไซคลิกหรือสารประกอบอะโรมาติก นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและกลไกการเกิดปฏิกิริยาต่าง ๆ ในห้องปฏิบัติการ รวมถึงการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มสารที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทหรือสารต้านมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถปรับเปลี่ยนได้ง่ายเพื่อให้ได้สารที่มีประสิทธิภาพและความเฉพาะเจาะจงสูง