[3-(trifluoromethoxy)phenyl]hydrazine ใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรมต่างๆ โดยเฉพาะสารที่ขัดต่อโรคระบบประสาทส่วนกลาง โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาที่มีคุณสมบัติต้านซึมเศร้าหรือยารักษาอาการทางจิต นอกจากนี้ยังนำมาใช้ในการพัฒนาสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช เนื่องจากช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของส่วนประกอบที่ออกฤทธิ์ ในงานวิจัยใช้ศึกษาพฤติกรรมของอนุพันธ์ไฮดราซีนในปฏิกิริยาอินทรีย์ เพื่อช่วยค้นพบเส้นทางเคมีและสารประกอบใหม่ๆ กลุ่ม trifluoromethoxy ช่วยเพิ่มความเสถียรและการดูดซึมทางชีวภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย ทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าในเคมีทางการแพทย์และเคมีเกษตร