6,6'-Diazido-6,6'-dideoxytrehalose ถูกใช้หลัก ๆ ในสาขาชีวเคมีและวิทยาศาสตร์วัสดุ โดยทำหน้าที่เป็นสารเชื่อมขวางในการพัฒนาไฮโดรเจลและวัสดุพอลิเมอร์อื่น ๆ กลุ่มไดอะซิโดของมันช่วยให้สามารถเข้าร่วมในปฏิกิริยาที่เหนี่ยวนำด้วยแสง ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างเครือข่ายที่เสถียรและเข้ากันได้ทางชีวภาพในวิศวกรรมเนื้อเยื่อและระบบการส่งยา นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์ไกลโคคอนจูเกตเพื่อศึกษาการโต้ตอบระหว่างคาร์โบไฮเดรตและโปรตีน ซึ่งช่วยในการพัฒนาวัคซีนและเครื่องมือวินิจฉัย โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของมันยังพบการประยุกต์ใช้ในการเตรียมวัสดุขั้นสูงที่มีคุณสมบัติทางกลและทางเคมีที่ปรับแต่งได้