5-Methylimidazole-4-carbonitrile ใช้ในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่針對โรคระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบที่มีศักยภาพต้านการอักเสบและยาแก้ปวด นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรเพื่อสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ บทบาทในงานสังเคราะห์อินทรีย์ขยายไปถึงการเตรียมสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิก ซึ่งมีคุณค่าในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับพัฒนาโพลิเมอร์และสารเคลือบขั้นสูง