ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านยา ซึ่งสารอนุพันธ์ของอิมิโดซอลมักแสดงฤทธิ์ต้านเชื้อจุลชีพ ต้านเชื้อรา หรือมีศักยภาพในการยับยั้งเอนไซม์บางชนิด เช่น เอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบหรือโรคมะเร็ง นิยมใช้เป็นตัวตั้งต้นในการสร้างสารที่มีโครงสร้างซับซ้อนในห้องปฏิบัติการ เพื่อพัฒนาเป็นสารออกฤทธิ์ใหม่ในอุตสาหกรรมยา