ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการผลิตยาที่มีโครงสร้างของอิมิดาโซล ซึ่งมีบทบาทในระบบประสาทและฮอร์โมน นิยมใช้เป็นตัวตั้งต้นในการสร้างสารตัวกลางสำหรับยาต้านมะเร็ง ยาต้านเชื้อไวรัส และยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยทางชีวเคมีเพื่อติดฉลากหรือดัดแปลงโมเลกุลชีวภาพ เช่น โปรตีน หรือกรดนิวคลีอิก เนื่องจากหมู่คลอโรเมทิลสามารถทำปฏิกิริยากับหมู่ฟังก์ชันที่เป็นนิวคลีโอไฟล์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ