Paquinimod ใช้ในการวิจัยและการรักษาโรคที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบและระบบภูมิคุ้มกัน โดยเฉพาะโรคที่มีการทำงานผิดปกติของระบบภูมิคุ้มกัน เช่น โรคเอสแอลอี (Systemic Lupus Erythematosus) และโรคเส้นเลือดอักเสบ (Vasculitis) นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเพื่อประเมินประสิทธิภาพในการรักษาโรคมะเร็งบางชนิด โดยการยับยั้งการทำงานของเซลล์ภูมิคุ้มกันที่สนับสนุนการเจริญเติบโตของเนื้องอก Paquinimod ยังมีศักยภาพในการลดการอักเสบเรื้อรังและปรับสมดุลการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกันในร่างกาย