Nucleoprotein 396-404 ใช้หลักในการวิจัยด้านภูมิคุ้มกันวิทยาและการพัฒนาวัคซีน มีบทบาทสำคัญในการศึกษาการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกัน โดยเฉพาะในบริบทของการติดเชื้อไวรัส นักวิจัยใช้ในการระบุและวิเคราะห์ epitope ซึ่งจำเป็นสำหรับการออกแบบวัคซีนที่ใช้เปปไทด์ นอกจากนี้ยังใช้เป็นเครื่องมือในการทำความเข้าใจการตอบสนองของ T-cell ช่วยในการพัฒนาอิมมูโนเทอราพีสำหรับโรคเช่นไข้หวัดใหญ่และการติดเชื้อไวรัสอื่นๆ การประยุกต์ใช้ขยายไปยังการทดสอบวินิจฉัย ซึ่งช่วยในการตรวจจับแอนติบอดีหรือเซลล์ภูมิคุ้มกันเฉพาะ สนับสนุนความก้าวหน้าในการจัดการโรคติดเชื้อ