ใช้ในงานวิจัยด้านชีววิทยาโมเลกุลและชีววิทยาของเซลล์ โดยเฉพาะในการศึกษาเกี่ยวกับการทำงานของโปรตีนฟอสฟาเทส 2B (calcineurin) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในเส้นทางสัญญาณของเซลล์ โดย Cyclosporin C สามารถยับยั้งการทำงานของ calcineurin ได้ คล้ายกับ Cyclosporin A แต่มีฤทธิ์ต้านภูมิคุ้มกันอ่อนกว่า จึงนิยมใช้เป็นเครื่องมือในการศึกษาเปรียบเทียบกลไกการทำงานของสารยับยั้ง calcineurin ในระบบชีวภาพ นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเบื้องต้นเกี่ยวกับศักยภาพในการต้านไวรัส โดยเฉพาะไวรัสบางชนิดที่พึ่งพา calcineurin ในการจำลองตัวเอง และมีคุณสมบัติต้านเชื้อรา รวมถึงการศึกษาบทบาทในการปกป้องไมโตคอนเดรีย ซึ่งอาจนำไปสู่การประยุกต์ใช้ในโรคทางระบบประสาทเสื่อมที่เกี่ยวข้องกับความเครียดของเซลล์