(S)-5,6-Difluoro-2,3-dihydro-1H-inden-1-amine ใช้หลักในการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการสังเคราะห์สารประกอบที่针对โรคระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างของสารนี้ทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่โต้ตอบกับตัวรับเฉพาะในสมอง ซึ่งอาจนำไปสู่การรักษาโรคเช่น ภาวะซึมเศร้า ความวิตกกังวล หรือโรคเสื่อมถอยของระบบประสาท นอกจากนี้ ลักษณะแบบ chiral ช่วยให้สามารถพัฒนายาที่บริสุทธิ์ทางเอนานติโอเมอร์ เพิ่มประสิทธิภาพและลดผลข้างเคียง นักวิจัยยังสำรวจประโยชน์ของสารนี้ในการออกแบบยารักษาใหม่ เนื่องจากการแทนที่ด้วยฟลูออรีนที่ไม่เหมือนใคร ซึ่งสามารถปรับปรุงความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมในร่างกาย