ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบอินดาโซลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านยาที่เกี่ยวข้องกับการยับยั้งเอนไซม์ เช่น เอนไซม์ kinase ซึ่งเกี่ยวข้องกับกระบวนการส่งสัญญาณในเซลล์มะเร็ง โครงสร้างของสารนี้ช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนได้ง่ายเพื่อสร้างอนุพันธ์ที่มีความจำเพาะและมีฤทธิ์แรงขึ้น นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อพัฒนายาต้านมะเร็งและยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ หมู่ trimethylsilyl ethoxy methyl (SEM) ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันไนโตรเจน ช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่งที่ต้องการในขั้นตอนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน