ฟีนอลฟทาลีนถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นตัวบ่งชี้ pH ในงานทดลองห้องปฏิบัติการและการวิเคราะห์เคมีต่างๆ มีประโยชน์โดยเฉพาะในการไตเตรทกรด-เบส โดยเปลี่ยนสีจากไม่มีสีในสารละลายกรดเป็นสีชมพูในสารละลายเบส โดยทั่วไปที่ pH 8.2 ถึง 10 คุณสมบัตินี้ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าในการกำหนดจุดสิ้นสุดของการไตเตรทที่เกี่ยวข้องกับกรดและเบสที่แรง

นอกจากบทบาทในการไตเตรท ฟีนอลฟทาลีนยังถูกใช้ในสถานศึกษาสำหรับแสดงการเปลี่ยนแปลง pH และปฏิกิริยาเคมี ช่วยให้นักเรียนเข้าใจแนวคิดของความเป็นกรดและด่างได้ชัดเจนยิ่งขึ้น นอกจากนี้ยังใช้ในบางการแพทย์ เช่น ในยาระบาย แม้ว่าการใช้ในด้านนี้จะลดลงเนื่องจากข้อกังวลด้านความปลอดภัย

นอกจากนี้ ฟีนอลฟทาลีนถูกนำไปใช้ในวิทยาศาสตร์นิติวิทยาสำหรับตรวจจับการมีอยู่ของเลือด เนื่องจากทำปฏิกิริยากับฮีโมโกลบินเพื่อให้เกิดการเปลี่ยนสี การประยุกต์นี้นำไปใช้ประโยชน์โดยเฉพาะในการสืบสวนสถานที่เกิดเหตุอาชญากรรม โดยรวมแล้ว ความหลากหลายในการบ่งชี้ pH และปฏิกิริยาต่อสารประกอบบางชนิดทำให้ฟีนอลฟทาลีนเป็นสารเคมีที่สำคัญทั้งในด้านวิทยาศาสตร์และการประยุกต์ใช้จริง