เมทิลเรดเป็นสารเคมีที่ใช้อย่างกว้างขวางในห้องปฏิบัติการทางเคมีและชีววิทยา หลักๆ แล้วใช้เป็นอินดิเคเตอร์สำหรับการวัดค่า pH เนื่องจากสามารถเปลี่ยนสีได้ชัดเจนในช่วง pH 4.4 ถึง 6.2 จากสีแดงเป็นสีเหลือง จึงเหมาะสำหรับการทดสอบกรด-เบสในสารละลายต่างๆ นอกจากนี้ยังใช้ในการวิเคราะห์ทางจุลชีววิทยาเพื่อตรวจสอบการผลิตกรดของแบคทีเรียบางชนิด ซึ่งช่วยในการจำแนกและศึกษาคุณสมบัติของจุลินทรีย์ ในอุตสาหกรรมบางประเภท เมทิลเรดอาจใช้ในกระบวนการควบคุมคุณภาพเพื่อตรวจสอบความเป็นกรด-เบสของผลิตภัณฑ์ด้วย