ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาเภสัชภัณฑ์ที่มีฐานอินโดลซับซ้อน โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งตัวรับเซโรโทนินและสารประกอบทางระบบประสาทอื่นๆ หน้าที่อัลดีไฮด์ที่ได้รับการป้องกันช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาแบบเลือกสรรที่หลายตำแหน่ง ทำให้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน ใช้กันทั่วไปในการเตรียมอนุพันธ์ทริปตามีนและอนุพันธ์ผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติสำหรับการคัดกรองทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการเคมีแบบรวมเพื่อสร้างห้องสมุดอินโดลในโปรแกรมค้นพบยา เนื่องจากหมู่ฟอร์มิลสามารถทำปฏิกิริยาต่อไปได้ เช่น การเติมสารนิวคลีโอไฟล์ ขณะที่หมู่ Boc ช่วยป้องกันไนโตรเจนไม่ให้ทำปฏิกิริยาในขั้นตอนแรก ทำให้ควบคุมการสังเคราะห์แบบเลือกสรรได้ดี เหมาะสำหรับการสร้างสารตั้งต้นในการสังเคราะห์อัลคาลอยด์และสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ