อินโดล-6-คาร์บอกซ์แอลดีไฮด์ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารตั้งต้นสำคัญสำหรับการผลิตสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพหลากหลาย มันมีคุณค่าอย่างยิ่งในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมสำหรับการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท มะเร็ง และการอักเสบ โครงสร้างของมันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการสังเคราะห์อัลคาลอยด์ที่อิงจากอินโดลและสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิกอื่นๆ ซึ่งจำเป็นในเคมียารักษา นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร รวมถึงยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช เนื่องจากบทบาทของมันในการสร้างสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะ ในงานวิจัย มันถูกใช้ในการศึกษาการโต้ตอบของเอนไซม์และกลไกการจับตัวรับ ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาด้านชีวเคมีและเภสัชวิทยา การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปถึงวิทยาศาสตร์วัสดุ ที่ซึ่งมันถูกสำรวจสำหรับการพัฒนาวัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์และโพรบเรืองแสง