ใช้ในขั้นตอนการสังเคราะห์สารประกอบอินโดลที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านยา ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนผ่านปฏิกิริยาคอปเปอร์หรือแพลเลเดียมเป็นตัวเร่ง เช่น การทำปฏิกิริยาแบบ Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig นิยมใช้ในสังเคราะห์สารที่มีศักยภาพทางเภสัชกรรม เช่น สารต้านมะเร็ง หรือสารออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากหมู่ Boc ช่วยป้องกันไนโตรเจนในวงอินโดลไม่ให้ทำปฏิกิริยาในขั้นตอนที่ไม่ต้องการ และสามารถถอดออกได้ง่ายในขั้นตอนสุดท้าย