ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารยับยั้งไคเนส โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านมะเร็ง ทำหน้าที่เป็นโครงสร้างหลักสำหรับสารประกอบที่เล็งเป้าไปยัง tyrosine kinases ซึ่งเกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของเนื้องอกและการสร้างหลอดเลือดใหม่ (angiogenesis) การดัดแปลงโครงสร้างช่วยในการปรับปรุงกิจกรรมทางชีวภาพและความจำเพาะในการคัดเลือกยาตัวสมัคร นอกจากนี้ยังมีการสำรวจในการออกแบบยาปกป้องระบบประสาท เนื่องจากแกนอินโดลิโนนแสดงความสัมพันธ์กับเป้าหมายในระบบประสาทส่วนกลาง นิยมใช้ในเคมียารักษาเพื่อศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างกับกิจกรรม (SAR)