ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบอินโดลีนและสารอนุพันธ์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาเพื่อพัฒนายาที่มีโครงสร้างเป็น heterocyclic compounds ทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้น (intermediate) ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนหรือคาร์บอน-ไนโตรเจนผ่านปฏิกิริยาเช่น cross-coupling reactions เช่น Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig นิยมใช้ในขั้นตอนการสร้างโมเลกุลยาที่ต้องการความเฉพาะเจาะจงสูง เช่น ยาต้านมะเร็ง หรือยาแก้โรคระบบประสาท เนื่องจากกลุ่ม Boc ช่วยป้องกันไนโตรเจนไม่ให้ทำปฏิกิริยาในขั้นตอนที่ไม่ต้องการ และสามารถกำจัดออกได้ง่ายภายหลังเมื่อต้องการเปิดใช้งานไนโตรเจนอีกครั้ง