ใช้ในสังเคราะห์เภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นสำคัญสำหรับพัฒนาสารประกอบชีวภาพ โดยเฉพาะในการผลิตตัวยับยั้งคินาสเลือกสรรและตัวปรับตัวรับเซโรโทนิน โครงสร้างฟลูออรีนช่วยเพิ่มความสัมพันธ์ในการจับและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมในยาตัวสมัคร นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาโพรบเรืองแสงและวัสดุออปโตอิเล็กทรอนิกส์ เนื่องจากโครงสร้างอะโรมาติกที่อุดมด้วยอิเล็กตรอนและคุณสมบัติทางโฟโตฟิสิกส์ที่เหมาะสม ใช้กันทั่วไปในงานวิจัยสำหรับการสร้างโครงสร้างอินโดลที่ซับซ้อนในเคมียารักษา โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้าและยาปรับสมดุลทางจิตใจ รวมถึงงานวิจัยด้านยามะเร็งและยารักษาโรคทางระบบประสาทเสื่อม ด้วยคุณสมบัติของหมู่ฟลูออรีนที่ช่วยเพิ่มความสามารถในการซึมผ่านของเซลล์และการจับกับตัวรับเฉพาะ