6-Bromoindoline hydrochloride ใช้ในการวิจัยทางเคมีและเภสัชวิทยาเพื่อศึกษากลไกการออกฤทธิ์ของสารเคมีและพัฒนายาใหม่ โดยเฉพาะในด้านเคมีอินทรีย์และเคมีเภสัชกรรม มันเป็นสารตั้งต้นที่สำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบอินโดลีนที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น สารต้านมะเร็งหรือสารที่มีผลต่อระบบประสาท นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีเพื่อพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ที่ใหม่และมีประสิทธิภาพมากขึ้น