6-Nitroindoline ใช้หลักๆ ในอุตสาหกรรมสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางในการเตรียมยาและสารเคมีทางการเกษตรต่างๆ โครงสร้างของมันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบที่มีศักยภาพทางชีวภาพ นักวิจัยนำมาใช้ในการสังเคราะห์อนุพันธ์ของอินโดล ซึ่งเป็นที่รู้จักสำหรับการประยุกต์ใช้ในเคมียารักษาโรค รวมถึงการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาทและมะเร็ง นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการศึกษาสารประกอบไนโตรอะโรมาติก เพื่อช่วยสำรวจปฏิกิริยาของสารเหล่านี้และการประยุกต์ใช้ที่เป็นไปได้ในวิทยาศาสตร์วัสดุ